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RNA互作圖譜

RNA結合蛋白（RBP）作為調控基因表達的關鍵因子，通過與靶RNA分子相互作用在細胞生理過程中發揮關鍵作用，控制著RNA在細胞內的加工、運輸和翻譯。這些調控功能對正常人體生理至關重要，RBP功能缺陷與多種遺傳性和獲得性疾病相關，如神經退行性疾病、自身免疫缺陷和癌癥。

Nat Methods發布eclip-seq：精準定位RBP結合位點的新一代利器！

為探究RBP作用機制，需精準定位其RNA結合位點。eCLIP-seq在RIP和iCLIP技術基礎上全面優化，不僅能捕獲RNA結合蛋白（RBP）的互作RNA，更能精確定位其在RNA上的結合位置，解決了傳統方法定位模糊、重復性差的問題。該技術為揭示轉錄后調控機制提供關鍵支持，是研究基因表達調控網絡的強大工具。

Robust transcriptome-wide discovery of RNA-binding protein binding sites with enhanced CLIP (eCLIP). Nat Methods. 2016

圖1. eCLIP-seq證明口腔癌中FXR1結合靶mRNA影響癌基因RNA穩定性進而調控腫瘤增殖。

Aksomics eCLIP-seq新品發布！

eCLIP-seq（enhanced UV crosslinking and immunoprecipitation增強型紫外交聯免疫共沉淀測序）是在經典iCLIP-seq技術基礎上優化而成的具有高效的“蛋白-RNA”相互作用研究手段。該技術首先通過紫外交聯固定細胞內特定蛋白與其結合的RNA的相互作用，然后利用特異性抗體富集目標RNA結合蛋白（RBP）及其結合的RNA片段，最終通過高通量測序實現在全轉錄組范圍內精確繪制RBP結合圖譜。

eCLIP-seq技術優勢

	?	分辨率高，精確定位RBP結合位置；
	?	準確度高，捕獲內源真實互作分子，有效避免假陽性和間接互作RNA；
	?	極大提升文庫有效復雜度，顯著減少冗余數據；
	?	可重復性高：標準化且穩健的實驗流程，支持大規模、可重復的RBP結合圖譜繪制；

康成

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RNA互作圖譜

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