核酸蛋白互作服務
服務介紹
CircRNA出發：
篩選有臨床診斷或預后價值的circRNA，針對連接點設計反向探針，做pulldown可富集蛋自或者RNA。富集的蛋白樣品后續可用于質譜鑒定，篩查circRNA結合的蛋白。富集RNA樣品主要用于分析circRNA結合的miRNA。
LncRNA出發：
篩選有臨床診斷或預后價值的LncRNA，采用經典的體外轉錄、標記法獲得待研究的生物素標RNA，再用生物素標記的RNA做pulldown富集蛋白或者RNA。富集的蛋白樣品后續可用于質譜鑒定，篩查LncRNA結合的蛋白。富集RNA樣品主要用于分析LncRNA結合的miRNA。體外轉錄法需要客戶提供質粒DNA模板，一般序列不超過3000nt。如果沒有質粒模板可以改用探針法，類似circRNA。
RNA結合蛋白出發：
篩選感興趣的RNA結合蛋白（包括經典的RNA結合蛋白、轉錄因子、附因子及其他任何重要的蛋白都可以嘗試），利用特異性的抗體富集RNA(RIP)或蛋白質(Co-IP)富集的RNA可以做高通量測序分析篩選蛋白結合的RNA，富集的蛋白可做質譜鑒定篩選結合蛋白。
服務流程
客戶提供
懸浮細胞直接收集，貼壁細胞用細胞刮直接刮下（不可用胰酶消化）。收集好后冰浴PBS洗1遍，離心后棄上清，細胞沉淀-80°C凍存，干冰運輸。
交付結果
原始數據、結果圖片標準實驗報告（含實驗步驟、流程及試劑耗材廠家）
送樣要求
懸浮細胞直接收集，貼壁細胞用細胞刮直接刮下（不可用胰酶消化）。收集好后冰浴PBS洗1遍，離心后棄上清，細胞沉淀-80℃凍存，干冰運輸。
具體各類型樣本量見下表：
樣品類型 | 細胞（1個反應） | 組織（1個反應） | ||
|---|---|---|---|---|
實驗類型 | 富集蛋白 | 富集RNA | 富集蛋白 | 富集RNA |
circRNA | 2 x 10^7細胞，circRNA序列 | 4 x 10^7細胞，circRNA序列 | 50 mg組織，circRNA序列 | 100 mg組織，circRNA序列 |
LncRNA | 2 x 10^7細胞，LncRNA模板及序列信息 | 4 x 10^7細胞，LncRNA模板及序列信息 | 50 mg組織，LncRNA模板及序列信息 | 100 mg組織，LncRNA模板及序列信息 |
RNA結合蛋白 | 2 x 10^7細胞，IP抗體10 ug | 4 x 10^7細胞，IP抗體20 μg | 50 mg組織 | 100 mg組織 |
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